作为广州市政协委员、广医委副主委，吴文起关注民生，积极参政议政，主笔的《疫情时代患者就医面临的问题和对策》获得社市委参政议政课题立项、《构建广州市互联网+统一医疗电子处方流转平台》获广州市政协提案立项，参与撰写的《建议下调我国新冠病毒核酸检测CT值标准》，获九三学社中央采用，并报全国政协和中央统战部。
  泌尿系结石是泌尿系统最常见疾病，对国民健康构成了严重威胁，给国家医疗体系带来了沉重的负担。吴文起在国际上最早揭示尿路细菌在代谢性结石形成中的作用，为结石的发病机制研究开辟了新方向。同时，吴文起作为主要主导者之一研发了世界首台体外物理排石机，为泌尿系结石治疗提供了革命性的新手段，目前该机已在全国范围1000余家医疗机构广泛应用，创造了数千万的经济效益。参与了国产一次性电子输尿管软镜的自主研发并实现产品转化。开展的新技术“经自然腔道输尿管肾盂内镜激光碎石负压清石术”，先后获评广州市临床重大技术、广东省适宜卫生推广技术及国家卫生健康技术，推动了结石微创治疗技术的广泛普及和标准化。在国内率先开展与推广应用红外光谱法的结石成分分析、24小时尿液成石危险因素分析，在2008年“婴幼儿三聚氰胺”事件中，率先建立了结石中三聚氰胺的分析方法，被国家卫健委采纳作为标准推广。同时建立了中国人群24小时尿液成石危险因素分析参考值，全面阐述了我国泌尿系结石人群的流行病学特征与结石成分特点，为我国结石预防体系的构建奠定了坚实基础。此外，积极参与国际学术交流与合作中，参与“国际尿石症联盟”的建立，在国际上推广“中国特色的微创经皮肾镜取石术”，在德国、意大利、希腊等多个国家进行20余次手术演示及30余场学术讲座，提升了我国泌尿外科学领域的国际影响力。吴文起始终坚持以患者为中心，不断钻研新技术、新方法，积极开创和应用国际先进的医疗理念和技术手段，为患者提供更精准、高效的治疗方案。以实际行动践行救死扶伤的初心。

  吴文起深学笃行习近平总书记关于科技创新和科学普及的重要论述，通过电视台、广州日报、三九健康网等信息平台，推送科学普及的文章、视频，开展系列科普讲座、直播，受众达300万人以上，获得广泛好评。主编出版科普图书《泌尿系统疾病100问》，提高了广大民众对泌尿系疾病的公共认知，获评“广州地区优秀科普图书作品”。积极组织、参与中华医学会泌尿外科分会 “走遍中国前列县（腺）”、中国红十字基金会“医路相伴—专家进基层患者关爱项目”及广东省医学会泌尿外科分会“广东省医学学术直通车”等大型健康公益活动，在新疆、安徽、河南等全国70余个省市地区进行义诊、科普讲座、公益手术共计120余场，免费赠送科普图书5000余本，为公益科普事业做出了突出贡献。
  吴文起不仅躬身力行致力科普活动推广，而且作为医院管理者不断推动“互联网医院+科普”一体化模式的建设和“广医二院互联网医院”服务系统的完善，提出了创建学科微信公众号、设立年度科普宣传目标、划分专科知识科普方向、激励科普创新等举措，构建了医院以学科导向的规范化科普宣传管理体系，力求将科普知识有效传播至广大民众。
  吴文起坚持育人为本，在学生指导过程秉承亲力亲为原则，与学生形成良好师生关系、教学氛围，目前共培养博士后、博士、硕士50余名，进修生200余名。指导的学生获得“国家奖学金”、“优秀毕业研究生”等荣誉奖励20余项，遍布省内外，成为了社会医疗服务的中坚力量。制作的《泌尿系结石》、《前列腺增生》等课件获得国家及广东省多媒体教育软件大奖赛一等奖等奖项。此外，钻研临床实习、教学模式的创新，作为医院科教负责人主导创建广州医科大学“实验统筹班”，制定发展规划，创新科创教育体系。
  “对学术专注，对患者用心”吴文起始终谨记导师——中国微创外科开拓者吴开俊教授的谆谆教诲，发扬老一辈科学家敢为人先、甘于奉献的科学家精神，“认真负责、追求创新、常常牺牲休息时间、引路人”成为学生们心中最深刻的印象，也成为学生们的行事楷模，言传身教、薪火相传的科学家精神传承，历久弥新。